Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sv2aQ9JIS5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sv2aQ9JIS5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms