Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup50Q9JIH2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms