Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms