Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms