Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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