Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dkc1Q9ESX5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dkc1Q9ESX5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms