Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms