Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms