Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms