Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm9sf1Q9DBU0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms