Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms