Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms