Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Q9D8Q6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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