Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fip1l1Q9D824 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms