Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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