Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms