Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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