Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Borcs6Q9D6W8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms