Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms