Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ptp4a3Q9D658 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ptp4a3Q9D658 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ptp4a3Q9D658 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ptp4a3Q9D658 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ptp4a3Q9D658 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ptp4a3Q9D658 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ptp4a3Q9D658 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ptp4a3Q9D658 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ptp4a3Q9D658 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ptp4a3Q9D658 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptp4a3Q9D658 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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