Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rab11fip1Q9D620 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rab11fip1Q9D620 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rab11fip1Q9D620 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rab11fip1Q9D620 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rab11fip1Q9D620 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rab11fip1Q9D620 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rab11fip1Q9D620 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Rab11fip1Q9D620 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rab11fip1Q9D620 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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