Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms