Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms