Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms