Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rsph14Q9D3W1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms