Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms