Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Krt20Q9D312 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Krt20Q9D312 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Krt20Q9D312 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Krt20Q9D312 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Krt20Q9D312 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Krt20Q9D312 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Krt20Q9D312 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Krt20Q9D312 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Krt20Q9D312 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Krt20Q9D312 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Krt20Q9D312 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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