Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf1Q9D2H9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf1Q9D2H9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms