Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Snapc3Q9D2C9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Snapc3Q9D2C9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snapc3Q9D2C9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Snapc3Q9D2C9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snapc3Q9D2C9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snapc3Q9D2C9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snapc3Q9D2C9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snapc3Q9D2C9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snapc3Q9D2C9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snapc3Q9D2C9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snapc3Q9D2C9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snapc3Q9D2C9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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