Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms