Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms