Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms