Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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