Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx17Q9D0I4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx17Q9D0I4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx17Q9D0I4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Stx17Q9D0I4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Stx17Q9D0I4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Stx17Q9D0I4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Stx17Q9D0I4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Stx17Q9D0I4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Stx17Q9D0I4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Stx17Q9D0I4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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