Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms