Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms