Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gins3Q9CY94 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms