Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms