Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih4Q9CX13 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cnih4Q9CX13 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cnih4Q9CX13 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cnih4Q9CX13 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih4Q9CX13 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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