Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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RpainQ9CWY9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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RpainQ9CWY9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms