Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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