Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms