Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cnot11Q9CWN7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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