Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms