Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms