Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PclafQ9CQX4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms