Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms