Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Nicn1Q9CQM0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Nicn1Q9CQM0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Nicn1Q9CQM0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms