Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms