Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms